Die Pfarrei Schengen entstand 1803 durch Ausgliederung aus der fortbestehenden Pfarrei Perl (D). Sie gehörte nach der Errichtung des Apostolischen Vikariates zum Dekanat Remich. 2009 wurde sie gemeinsam mit den Pfarreien Bech-Kleinmacher, Remerschen, Schwebsingen und Wellenstein zum Pfarrverband Schengen-Wellenstein zusammengefasst. 2017 erfolgte die Auflösung der Pfarrei und des Pfarrverbandes im Rahmen der territorialen Neugliederung der Erzdiözese Luxemburg. Das Territorium der Pfarrei wurde vollständig der neuen Pfarrei "Dräilännereck Musel a Ganer Saint-Nicolas" zugeordnet.